Wydział Matematyki, Fizyki i Informatyki tworzą dwa instytuty: Instytut Matematyki i Informatyki oraz Instytut Fizyki.
Prezydium Polskiej Komisji Akredytacyjnej w sprawie oceny instytucjonalnej na Wydziale Matematyki, Fizyki i Informatyki Uniwersytetu Opolskiego wydało ocenę pozytywną.
Wydział posiada dwa uprawnienia do nadawania stopnia naukowego:
-  doktora nauk fizycznych w zakresie fizyki,
-  doktora nauk matematycznych w zakresie matematyki.
Główne kierunki badań naukowych
a)    w Instytucie Matematyki i Informatyki:
- algebraiczna logika matematyczna,
- informatyka teoretyczna,
- statystyka matematyczna,
- topologia ogólna,
- zastosowania matematyki;
b)     w Instytucie Fizyki:
- fizyka doświadczalna, w tym:
–  fizyka fazy skondensowanej,
–  spektroskopia plazmy,
–  biofizyka,
- fizyka teoretyczna, w tym:
–  nierównowagowa fizyka statystyczna,
–  fizyka fazy skondensowanej,
–  fizyka matematyczna,
–  astrofizyka i kosmologia,
- fizyka obliczeniowa, w tym:
–  metody obliczeniowe w fizyce ciała stałego i nanostruktur,
–  symulacje komputerowe profili implantacji pozytonów,
–  obliczenia ab initio.